defter*
defter / katalog / MBG 509
MBG 509

Special Topics in Molecular Biology I

A graduate seminar course where you spend most Wednesdays listening to invited researchers from Bilkent, METU, Koç, Sabancı, and international institutes present their current work on things like RNA design, cancer genomics, chromatin regulation, and zebrafish disease models. The real skill being trained is reading primary literature critically and engaging with active researchers, which is why assessment leans on quizzes tied to each talk, a take-home midterm, and your participation in Q&A rather than traditional exams. It exists to plug incoming MBG graduate students into the regional research community early and to sharpen the habits, question-asking, abstract-writing, contextualizing unfamiliar data, you will need for your own thesis work.

Kredi3ECTS5FakülteFaculty of ScienceBölümMolecular Biology and GeneticsKoordinatörÖzlen Konu Karakayalı

Haftalık müfredat 14 hafta

Hafta 114–20 Eyl
Kolokyum konuşması ve derse giriş
17.09.2025-- Colloquium Talk followed by First Class Meeting: INTRODUCTION TO THE COURSE (Seminar Room next to the elevator))
kolokyumderse giriş
Hafta 221–27 Eyl
Seminer: RNAtranslator ile RNA tasarımı
24.9.2025-- Speaker: Dr. Ercument Cicek. Associate Professor in Computer Science Department, Bilkent University, Ankara, TR. TITLE: "RNAtranslator Modeling protein-conditional RNA design as sequence-to-sequence natural language translation"
RNAtranslatorprotein-conditional RNA designsequence-to-sequenceErcument Cicek
Hafta 328 Eyl – 4 Eki
Seminer: HCC'de mitotic cell cycle genleri
01.10.2024-- Speaker: Dr. Ceren Sucularli, Department of Informatics: Hacettepe University, Health Sciences Institute, Department of Informatics, Ankara. TITLE: "Mitotic Cell Cycle Genes in HCC: Biomarker Discovery for Diagnostic Classification and Prognostic Risk Stratification with Machine Learning"
Dr. Ceren Sucularlimitotic cell cycle genesHCCmachine learning
Hafta 45–11 Eki
Göz hastalıklarında zebrafish preklinik modelleri
8.10.2025-- Speaker: Dr. Gulcin Cakan-Akdogan, IBG, Izmir. TITLE: "Emerging Zebrafish Preclinical Models for Inherited and Degenerative Eye Diseases"
zebrafish preclinical modelkalıtsal ve dejeneratif göz hastalıklarıGulcin Cakan-AkdoganIBG İzmir
Hafta 512–18 Eki
Seminer: chromatin ve embryonic stem cell
15.10.2024-- Speaker: Dr. Nihal Terzi Cizmecioglu, Dept. MBG, METU, Ankara, TR. TITLE: "Chromatin-based control of mouse embryonic stem cell lineage commitment"
Nihal Terzi Cizmeciogluchromatinmouse embryonic stem celllineage commitment
Hafta 619–25 Eki
Seminer: Dr. Nurcan Tuncbag, konu TBA
22.10.2025-- Speaker: Dr. Nurcan Tuncbag, Department of MBG, Koc University, Istanbul, TR. TITLE: TBA
Nurcan TuncbagKoc UniversityMBGTBA
Hafta 726 Eki – 1 Kas
Bu hafta seminer yok
29.10.2025-- NO SEMINAR;
no seminar
Hafta 82–8 Kas
Seminer: Dr. Sreeparna Banerjee (METU MBG)
5.11.2025-- Speaker: Dr. Sreeparna Banerjee. MBG Dept., METU, Ankara, TR. TITLE: TBA;
Sreeparna BanerjeeMBG Dept. METUbaşlık TBA
Hafta 99–15 Kas
Seminer: Lumos ile Cancer Genome Reconstruction
12.11.2025-- Speaker: Dr. Ayse Gökçe Keskus. NIH, Bethesday, USA. TITLE: "Lumos: Long-Read Tool for Haplotype-Aware Reconstruction of Complex Cancer Genomes"
Lumoslong-readhaplotype-aware reconstructionAyse Gökçe Keskus
Hafta 1016–22 Kas
Konuk seminer: Dr. Ogun Adebali, başlık TBA
19.11.2025-- Speaker: Dr. Ogun Adebali. Sabanci University, Istanbul, TR, TITLE: TBA
Dr. Ogun AdebaliSabanci UniversityTBA
Hafta 1123–29 Kas
Seminer: hücre iletişiminden DNA diline
26.11.2025-- Speaker: Dr. Sevi Durdu. Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research, Basel, TITLE: "From Cell Communication to DNA Language: Codes for Building Functional Tissues"
cell communicationDNA languagefunctional tissuesSevi Durdu
Hafta 1230 Kas – 6 Ara
Konuk konuşmacı Murat Eren ve take-home midterm
3.12.2025-- Speaker: Prof. Dr. Murat Eren. Max Planck Institute for Marine Biology and Helmholtz Institute for Functional Marine Biodiversity, Germany: TBA;Take-home Midterm due on 1.12.2025
Murat ErenMax Planck Institutetake-home midterm
Hafta 137–13 Ara
Seminer: Grant Navid Doering, başlık TBA
10.12.2024-- Speaker: Grant Navid Doering, Dept. Neuroscience, Bilkent Unıversity, Ankara. TITLE: TBA
Grant Navid DoeringNeuroscienceBilkent UniversityTBA
Hafta 1414–20 Ara
Seminer: çok işlevli protein DEK
17.12.2023-- Speaker: Dr. Ayten Kandilci. GYE, MBG Department, Istanbul, TR. TITLE: "A Multifunctional Protein: DEK"; Presentations
DEKDr. Ayten Kandilciproteinsunumlar

Değerlendirme 100% · 4 adım

10%
40%
30%
20%
Midterm:Take-home Preparation of an AI assisted report proposing a followup experiment to an invited speaker 10%
Quiz in class/online attendance and posting a question-answer on Moodle 40%
Final Oral presentation recording on zoom on Midterm Report and Q-A on Moodle 30%
In-class participation Ask Questions to Speakers in class 20%
en büyük tek kalem %40 · sınav ağırlığı %80 · 19 dönem ortalaması 3.84 (256 öğrenci) nasıl hesaplanıyor

Bu dersi alınca · 4 öğrenme çıktısı

Bilkent'in resmî syllabus'ünden. Sağdaki etiket o çıktının hangi değerlendirmeyle ölçüldüğünü söylüyor.

Ders notları · henüz yok

MBG 509 için defter ekibi henüz not yazmadı.

İlk dosyayı sen atarsan: not, slayt, geçmiş sınav, çözüm, cheat-sheet, ne varsa. defter ekibi öğrenci paylaşımlarından bu dersin notlarını yazar. Drive linki / PDF / ZIP, hepsi olur.

← katalog

Geçmiş GPA dağılımı 19 dönem · ort. 3.84

DönemCourse CPA
2025-2026 Fall 3.84 1 sec · 9 öğr
2024-2025 Fall 3.76 1 sec · 8 öğr
2023-2024 Fall 3.57 1 sec · 10 öğr
2022-2023 Fall 3.60 1 sec · 21 öğr
2021-2022 Fall 3.85 1 sec · 11 öğr
2020-2021 Fall 3.78 1 sec · 6 öğr
2019-2020 Fall 4.00 1 sec · 13 öğr
2018-2019 Fall 3.89 1 sec · 9 öğr
2017-2018 Fall 4.00 1 sec · 16 öğr
2016-2017 Fall 3.73 1 sec · 12 öğr

Aggregate course GPA · Bilkent STARS'tan public data. Hoca-bazlı per-section detayı için STARS evaluation report →. Öğrenci anket cevapları KVKK kapsamında defter'de tutulmaz. Tüm derslerin ortalamaları →

Bu dönem · 2026-2027 Güz · 1 şube · 35 kontenjan

haftada 3 saat ders

Haftalık ızgarada 4 saat görünüyor, kayıt sistemi dersi 3 saat yazıyor. Aradaki 1 saat yedek saat: Bilkent programlarında derse genelde bir fazla saat ayrılır ve çoğu zaman kullanılmaz. Hangisinin düşeceği dönem başlayınca belli olur.

1
Fulya Türker
Pzt10:30–12:20Çar15:30–17:20
35
kişilik
Genelde sadece güzSon yıllarda 30 kez güz döneminde açılmış, 2 kez bahar. Bu dönem alamazsan bir sonraki güzü beklemen gerekebilir.

⚠️ FZ engelleyen şartlar

Full attendance and submission on Moodle of all seminar quizzes. Please contact the coordinator if you have an emergency, medical report or such before the presentation.

Hocalar 1 bu dönem · 21 geçmiş

Bu dönem (2026-2027 Fall) · 1 section
Fulya Türker
Geçmişte ders veren (21 kişi)
Özlen Konu Karakayalı, İlyas Chachoua, Pınar Önal, Serkan İsmail Göktuna, Işık Yuluğ, Serkan Belkaya, Bahar Değirmenci Uzun, Onur Çizmecioğlu, Murat Alper Cevher, Özgür Şahin, Rengül Çetin-Atalay, Ebru Erbay, Uygar Halis Tazebay, M. Cengiz Yakıcıer, Ali Osmay Güre +6 kişi daha